Biochimica - Aminoacidi

Prima lezione di Biochimica Appunti 05/10/2006 rispecchiano il genoma dell'individuo ) Prima lezione di Biochimica Appunti 05/10/2006 Per descrivere chimicamente gli aminoacidi c'è bisogno di descrivere delle caratteristiche peculiari di tale molecola organica. Innanzitutto Gli aminoacidi contengono una funzione basica ed una acida ,infatti troviamo generalmente almeno un gruppo acido ( il gruppo carbossilico) e un gruppo basico (il gruppo amminico ); ma non tutte quelle molecole che contengono questi due gruppi sono necessariamente degli aminoacidi. Gli aminoacidi sono alcuni tra le molecole organiche più semplici , sono delle unità fondamentali per la biosintesi di peptidi e proteine ( Macromolecole costituite dal susseguirsi di unità aminoacidiche le uniche macromolecole che rispecchiano il genoma dell'individuo) Inoltre gli aminoacidi in virtù della presenza di questi due gruppi funzionali sono ionizzabili , cioè sono in grado di accettare o perdere almeno due protoni , in regioni di PH comprese tra il 2-4 (per il gruppo carbossilico ) e in regioni tra il 10-12( per il gruppo amminico ), per ionizzazione (affinità con il protone )acida e basica . Oltre a queste caratteristiche per dire che stiamo parlando davvero di un aminoacido bisogna dire inoltre che sia il gruppo amminico che il gruppo carbossilico devono essere necessariamente legati ad uno stesso carbonio tetraedrico ibridato sp3 che possa cioè legare 4 sostituenti attraverso altrettanti legami covalenti . Infine per essere veramente un aminoacido il terzo sostituente del carbonio ( oltre al gruppo amminico e il gruppo carbossilico ) deve essere un H (idrogeno). Struttura generale degli aminoacidi Gli aminoacidi si presentano generalmente sotto questa forma (struttura , come vedremo in seguito, degli aminoacidi al punto isoelettrico in cui la carica totale si presenta =0 e l'aminoacido si presenta sottoforma di ioni dipolari o zwitterioni ): COO- | H-C-R | NH3+ In questa molecola il carbonio ( denominato anche carbonio ? perché quello legato direttamente ai gruppi aminnico e carbossilico) è quasi sempre un carbonio chirale perché possiede quattro sostituenti diversi quindi in grado di ruotare la luce polarizzata . L'unico aminoacido che non è chirale è la glicina in cui il gruppo R è l'idrogeno . Gli aminoacidi di importanza biologica sono tutti della serie L , ci possono essere anche degli aminoacidi della serie D che possono essere tipici di alcuni batteri oppure dovute a modifiche post-traduzionali . Sono anche tutti ?-aminoacidi ciò significa che al carbonio sono legati sia il gruppo amminico che il gruppo carbossilico e appunto ripetiamo che il carbonio centrale è definito ? per distinguerli da altri possibili carboni della catena laterale R . La massa molecolare media è di circa 110 u.m.a. quindi di basso peso molecolare . Tra gli aminoacidi c'è un'eccezione nella struttura base che è quella della PROLINA un aminoacido eterociclico con un anello a cinque termini che si chiude su Continua »